Поселение основано в 1860 году как станица 3-й Урупской бригады Кавказского линейного казачьего войска. Приказ генерал-фельдмаршала А.И. Брятинского по Кавказской армии № 186 от 3 мая 1860 года, изданный в Тифлисе, гласил: «станицам, водворяемым в нынешнем году на обоих крыльях Кавказской линии, присваиваются следующие наименования: 1) станице в верховьях Урупа — Преградная…». В приказе по Военному ведомству  от 28 мая 1860 года № 127 указано: «Государь Император… соизволил утвердить… новым станицам Кавказского линейного казачьего войска следующие наименования: …в верховьях Урупа — Преградная…». На основании предполагаемых военных действий на 1860 год, штаб войск Кавказской линии (в последующем Кубанской области), в течении осени 1859 года и весны 1860 года готовил отряд переселенцев.

В 1862 году станица Преградная входила в Кубанскую область. В станице имелось станичное правление и сотенная канцелярия. В год основания в станице открылась школа, в которой обучали грамматике, чистописанию, арифметике, чтению Закона Божьего. В 1865 году в школе обучалось 20 станичных мальчиков.

В 1863 году кроме станичного правления в станице Преградной располагались молитвенный Дом и пожарный сарай.

Покровская церковь ст. Преградной построена тщанием прихожан в 1869 году. В 1877 году алтарная часть храма сильно осела, колокольные столбы обветшали. Она оказалась непригодной. Поэтому в 1879 году на средства Кубанского казачьего войска прихожане купили в станице Псеменской деревянную церковь, с такой же колокольней, установили и освятили ее 22 января 1882 года.  Приход насчитывал -2749 душ православных верующих.

Жители станицы занимались охраной границы Российской Империи, в свободное от службы время занимались животноводством и растениеводством. Казаки- переселенцы устанавливали дружеские отношения с горцами. Передавали им опыт земледелия, а от них перенимали секреты горного скотоводства.

С 1889 года станица Преградная  стала входить в Баталпашинский отдел Кубанской области. В 1923 году  Баталпашинский отдел был упразднен и станица Преградная вошла в Отрадненский район Армавирского округа Северо-Кавказского края, а затем в Удобненский район  Армавирского округа Азово-Черноморского края.

В 1935 году станица Преградная была передана в состав Карачаевской автономной области. 7 сентября 1938 года в составе Карачаевской автономной области был образован Преградненский район и станица Преградная стала районным центром.

7 ноября 1943 года в результате упразднения Карачаевской автономной области станицу Преградную передали в Кировский район Черкесской автономной области.

С 1965 года станица Преградная вновь стала районным центром  Урупского района Карачаево- Черкесской автономной области.